| Dersin Türü | Seçmeli |
|---|
| Dersin Düzeyi | Doktora |
|---|
| Dersin Yılı | - |
|---|
| Dersin Yarıyılı | - |
|---|
| AKTS | 8 |
|---|
| Öğretim Eleman(lar)ı |
- |
| Öğrenme Kazanımları |
Bu dersin sonunda öğrenciler;
- Bakteriyofajların biyolojisi, sınıflandırılması, yaşam döngüleri ve konak-faj etkileşimlerinin moleküler mekanizmalarını ayrıntılı olarak açıklar.
- Bakteriyofajların izolasyonu, pürifikasyonu, çoğaltılması, karakterizasyonu ve titre tayini için kullanılan temel laboratuvar yöntemlerini planlar ve uygular.
- Bakteriyofajların biyofiziksel özelliklerini, morfolojik yapılarını ve genomik özelliklerini deneysel ve biyoinformatik yaklaşımlarla analiz eder ve elde edilen verileri yorumlar.
- Bakteriyofajların tanı, biyokontrol, faj terapi ve faj-antibiyotik kombinasyonları gibi biyomedikal ve biyoteknolojik uygulamalarını bilimsel kanıtlar doğrultusunda değerlendirir
- Faj-konak etkileşimlerinde direnç gelişimi, virülans faktörleri ve faj lizinleri gibi güncel araştırma konularını eleştirel bir bakış açısıyla analiz eder ve literatürle ilişkilendirir.
- Bakteriyofaj araştırmalarına yönelik deney tasarlar, elde edilen sonuçları bilimsel etik ilkeleri doğrultusunda değerlendirir ve araştırma süreçlerinde kullanır
|
| Veriliş Biçimi | Yüz Yüze |
|---|
| Önkoşullar | Yok |
|---|
| Önerilen Dersler | Biyoinformatik
Moleküler Mikrobiyoloji |
|---|
| Ders Tanımı | Bu ders, bakteriyofajların biyolojik özellikleri, sınıflandırılması, enfeksiyon mekanizmaları, konak-faj etkileşimleri ve fajların farklı kullanım alanlarına ilişkin temel ve güncel bilgileri kapsamaktadır. Ders kapsamında bakteriyofaj izolasyonu, pürifikasyonu, karakterizasyonu, çoğaltılması, titre tayini, biyofiziksel analizleri, genomik ve biyoinformatik analizleri ile faj terapi uygulamalarında kullanılan temel laboratuvar yöntemleri teorik ve uygulamalı olarak ele alınmaktadır. Ayrıca, öğrencilerin bakteriyofaj araştırmalarında deney planlama, elde edilen verileri yorumlama ve güncel literatürü değerlendirme becerilerinin geliştirilmesi hedeflenmektedir. |
|---|
| Ders İçeriği |
| HAFTA |
KONULAR |
|
1. Hafta |
Bakteriyofajlara Giriş ve Genel Tanımlar |
|
2. Hafta |
Bakteriyofajların Tarihçesi ve Yapılan Araştırmalar/ Bakteriyofaj Çalışmalarında Temel Laboratuvar Teknikleri |
|
3. Hafta |
Temel Faj Biyolojisi /Bakteriyofaj Çalışmalarında Gerekli Besiyerlerinin Hazırlanması |
|
4. Hafta |
Bakteriyofaj Sınıflandırması / Çevresel Örneklerden Faj İzolasyonu ve Pürifikasyonu |
|
5. Hafta |
Faj Enfeksiyonunun Moleküler Mekanizması /Faj Solüsyonunun Hazırlanması, Fajların Saklanma Koşulları |
|
6. Hafta |
Patojenik Bakterilerin Tanımlanmasında Fajlar /Double Layer Assay ve Titre Sayımı |
|
7. Hafta |
Faj Lizinleri ve Lizis /One-Step Growth Curve Deneyi |
|
8. Hafta |
Faja Karşı Direnç Gelişimi / Multiplicity of Infection (MOI) Belirlenmesi |
|
9. Hafta |
Fajlar ile Kodlanan Virülans Faktörleri /Adsorpsiyon Deneyi |
|
10. Hafta |
Fajların Tam Genom Analizi ve Biyoinformatiği / Faj Viral DNA Ekstraksiyonu ve Restriksiyon Profillerinin Belirlenmesi |
|
11. Hafta |
Faj-Antibiyotik Kombinasyonu /Fajların Biyofiziksel Stabilitelerinin Belirlenmesi |
|
12. Hafta |
İnsanlarda Faj terapi / Fajların Morfolojilerinin Belirlenmesi ve TEM için Numune Hazırlığı |
|
13. Hafta |
Fajların Kullanım Alanları / Faj Genom Analizi |
|
| Kaynaklar | Kutter, E., & Sulakvelidze, A. (Eds.). (2005). Bacteriophages: Biology and Applications. CRC Press.
Calendar, R., & Abedon, S. T. (Eds.). (2021). The Bacteriophages (3rd ed.). Oxford University Press.
Clokie, M. R. J., Kropinski, A. M., & Lavigne, R. (Eds.). (2021). Bacteriophages: Methods and Protocols. Humana Press (Methods in Molecular Biology).
|
|---|
| Öğretim Yöntemleri |
- Anlatım
- Tartışma
- Soru-Cevap
- Deney
- Sunum
|
|---|
| Değerlendirme |
Sunum %25
Uygulama Soru/Cevap %25
Final %50
|
| AKTS İş Yükü |
| Aktivite |
Sayı |
Süre (Saat) |
İş Yükü |
| Ara Sınav |
|
|
|
| Kısa Sınavlara hazırlık |
|
|
|
| Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi |
|
|
|
| Final Sınavına Hazırlık |
|
|
|
| Ders Saati |
|
|
|
| Ara Sınava Hazırlık |
|
|
|
| Laboratuvar |
|
|
|
| Final Sınavı |
|
|
|
| Ödevler |
|
|
|
| Toplam İş Yükü | 0 |
| Toplam İş Yükü / 30 | 0 |
| Dersin AKTS Kredisi | 8 |
|
| Dil | Türkçe |
|---|
| Staj / Uygulama | Yok |
|---|
