INTRODUCTION TO OMICS TECHNOLOGIES

MBGE345

Ders Kodu: MBGE345
Yarıyıl: -
Teori+Uygulama: 3 + 0
AKTS: 4

Dersin Türü

Seçmeli

Dersin Düzeyi

Lisans

Dersin Yılı

Dersin Yarıyılı

AKTS

Öğretim Eleman(lar)ı

Doçent Doktor Ceyhun Kayıhan

Öğrenme Kazanımları

Bu dersin sonunda öğrenciler;

Omiks teknolojisinin tarihsel sürecini ve çeşitlerinin bilir.
Genomiks, fonksiyonel genomiks ve proteomiks teknolojilerinin temellerini, kullanım alanlarını ve güncel uygulamalarını bilir.
Omiks verilerini birleştirerek sistem biyolojiyi bilir.

Veriliş Biçimi

Yüz Yüze

Önkoşullar

Yok

Önerilen Dersler

Yok

Ders Tanımı

Bu derste öğrenciler, omiks teknolojisinin tarihsel sürecini ve çeşitlerini, genomiks, fonksiyonel genomiks ve proteomiks temellerini, kullanım alanlarını ve güncel uygulamalarını bilir.

Ders İçeriği

HAFTA	KONULAR
1. Hafta	Derse giriş, tarihsel süreç
2. Hafta	Genler, genomlar, insan genom projesi
3. Hafta	Model organizma genomları, yüksek kapasiteli vektörler
4. Hafta	DNA sekans metodları
5. Hafta	Genom haritalama
6. Hafta	Genom sekans metodları
7. Hafta	Genom sekans anotasyonları
8. Hafta	Fonksiyonel genomiks I
9. Hafta	Fonksiyonel genomiks II
10. Hafta	Proteomiks I
11. Hafta	Proteomiks II
12. Hafta	Fosfoproteomiks, Glikoproteomiks
13. Hafta	Sistem biyoloji
14. Hafta	Tartışma

Kaynaklar

Applications of Advanced Omics Technologies: From Genes to Metabolites, Virginia Garcia-Canas Alejandro Cifuentes Carolina Simo, Volume 64, 1st Edition
Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy and Ponnusamy Ramalingam, 2011.
Introduction to Proteomics Tools for the New Biology, DANIEL C. LIEBLER 2002.
Principles of Genome Analysis and Genomics, Sandy B. Primrose,
Richard M. Twyman, Third Edition, 2003

Öğretim Yöntemleri

Anlatım
Tartışma
Soru-Cevap
Sorun/Problem Çözme
Proje
Sunum

Değerlendirme

	Sayısı	Toplam Katkısı (%)
Ara Sınav	1	30
Proje	1	15
Devam	1	5
Makale Sunuşu	1	10
Toplam(%)		60
Yıl İçinin Başarıya Oranı(%)		60
Finalin Başarıya Oranı(%)		40
Toplam(%)		100

AKTS İş Yükü

Aktivite	Sayı	Süre (Saat)	İş Yükü
Ara Sınav	1	2	2
Kısa Sınavlara hazırlık
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi	13	2	26
Final Sınavına Hazırlık	1	22	22
Ders Saati	14	3	42
Ara Sınava Hazırlık	1	18	18
Laboratuvar
Final Sınavı	1	2	2
Ödevler
Sunum (Hazırlık dahil)	1	8	8
Toplam İş Yükü			120
Toplam İş Yükü / 30			4
Dersin AKTS Kredisi			4

Dil

İngilizce

Staj / Uygulama

Yok

Program Yeterlilikleri / Öğrenme Kazanımları

	Ö1	Ö2	Ö3
P1	X	X	X
P2	X	X	X
P3
P4
P5
P6
P7
P8
P9	X	X	X
P10
P11	X	X	X
P12
P13