| Dersin Türü | Seçmeli |
|---|
| Dersin Düzeyi | Lisans |
|---|
| Dersin Yılı | - |
|---|
| Dersin Yarıyılı | - |
|---|
| AKTS | 4 |
|---|
| Öğretim Eleman(lar)ı |
- |
| Öğrenme Kazanımları |
Bu dersin sonunda öğrenciler;
- Biyolojik veritabanlarını, ileri ve çoklu dizi hizalamalarını, hizalama algoritmalarını ve modellerini anlar.
- İleri dizi ve bölge tahminleme ve filogenetik ağaç uygulamalarını bilir.
- Protein ve RNA ikincil yap tahminleme çalışmalarını anlar.
- Ders içeriğinin bilgisayardaki tüm uygulamalarını yapabilir, ilgi alanı doğrultusunda çalışma yapabilir ve sonuçlarını tartışabilir.
|
| Veriliş Biçimi | Yüz Yüze |
|---|
| Önkoşullar | Yok |
|---|
| Önerilen Dersler | Yok |
|---|
| Ders Tanımı | Biyoinformatik, biyolojik verilerin anlamlandırılması, saklanması, görsellenmesi ve bu devasa bilgi birikiminden azami ölçüde yararlanabilmek amacıyla, matematik, istatistik, bilgisayar bilimleri, moleküler biyoloji ve genetik alanlarının sentezini içeren konular bütünlüğünde, karmaşık biyolojik verilerin derlenmesi ve analiz edilmesi, öğrencilerin multidisipliner bakış açısı kazanması, aynı zamanda genomik ve proteomik veriler arasındaki yaklaşımlarla ilişki kurması amaçlanmaktadır. |
|---|
| Ders İçeriği |
| HAFTA |
KONULAR |
|
1. Hafta |
Biyolojik veritabanları |
|
2. Hafta |
Çoklu dizi hizalama ve modeller |
|
3. Hafta |
Bilgisayar uygulaması |
|
4. Hafta |
Promotör ve düzenleyici bölge tahminlemeleri |
|
5. Hafta |
Protein dizi motifleri ve bölge tahminleme |
|
6. Hafta |
Bilgisayar uygulaması |
|
7. Hafta |
Filogenetik ağaç oluşturma yöntemleri ve programlar |
|
8. Hafta |
Bilgisayar uygulaması |
|
9. Hafta |
Protein yapılarının karşılaştırılması |
|
10. Hafta |
Protein yapı tahminlemeleri |
|
11. Hafta |
İkincil RNA yapı tahminlemeleri |
|
12. Hafta |
Bilgisayar uygulaması |
|
13. Hafta |
Öğrenci projeleri ve tartışma |
|
14. Hafta |
Öğrenci projeleri ve tartışma |
|
| Kaynaklar | Essential Bioinformatics. Jin Xiong. Cambridge University Press, 2006. |
|---|
| Öğretim Yöntemleri |
- Anlatım
- Tartışma
- Eğitim-Uygulama
- Proje
|
|---|
| Değerlendirme |
|
Sayısı |
Toplam Katkısı (%) |
| Ara Sınav |
1 |
35 |
| Uygulama/Pratik |
1 |
25 |
| Toplam(%) |
|
60 |
| Yıl İçinin Başarıya Oranı(%) |
|
60 |
| Finalin Başarıya Oranı(%) |
|
40 |
| Toplam(%) |
|
100 |
|
| AKTS İş Yükü |
| Aktivite |
Sayı |
Süre (Saat) |
İş Yükü |
| Ara Sınav |
1 |
2 |
2 |
| Kısa Sınavlara hazırlık |
|
|
|
| Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi |
|
|
|
| Final Sınavına Hazırlık |
1 |
35 |
35 |
| Ders Saati |
14 |
2 |
28 |
| Ara Sınava Hazırlık |
1 |
25 |
25 |
| Laboratuvar |
|
|
|
| Final Sınavı |
1 |
2 |
2 |
| Ödevler |
|
|
|
| Uygulama |
14 |
2 |
28 |
| Toplam İş Yükü | 120 |
| Toplam İş Yükü / 30 | 4 |
| Dersin AKTS Kredisi | 4 |
|
| Dil | İngilizce |
|---|
| Staj / Uygulama | Yok |
|---|
