Bilgi Paketi

Moleküler Biyoloji ve Genetik Programı (İngilizce)

MBGE215

INFORMATICS TECHNOLOGIES FOR BIOLOGICAL SCIENCES

Ders Kodu
MBGE215
Yarıyıl
Üçüncü Yarıyıl (Güz)
Teori+Uygulama
0 + 2
AKTS
2
Dersin TürüZorunlu
Dersin DüzeyiLisans
Dersin Yılı2
Dersin YarıyılıÜçüncü Yarıyıl (Güz)
AKTS2
Öğretim Eleman(lar)ı
Öğrenme Kazanımları

Bu dersin sonunda öğrenciler;

  1. Literatür taramasında internet kullanımını öğrenir.
  2. Biyolojik literatür arama motorları ve veri tabanlarında nasıl arama yapılması gerektiğini öğrenir.
  3. Moleküler biyoloji ve genetik alanındaki çeşitli deneysel çalışmalar sonucu elde edilen verileri Excel'deki temel hesaplamaları kullanarak analiz eder ve değerlendirir.
  4. Çeşitli deneysel çalışma sonuçlarının gösterimi için Excel programını kullanarak grafik düzenleyebilir ve grafik olarak gösterilen verilere uygun eğri uydurma ve eğri denklemini okuma gibi temel fonksiyonların kullanımını öğrenir.
  5. Moleküler biyoloji ve genetik alanındaki çeşitli çalışmaların sonuçlarını ImageJ programını kullanarak analiz eder ve değerlendirir.
Veriliş BiçimiYüz Yüze
ÖnkoşullarYok
Önerilen DerslerYok
Ders TanımıBu derste öğrenciler, biyolojik literatürün organizasyonunu, moleküler biyoloji ve genetik ile ilgili literatür ve veri tabanlarında arama yapabilmek için gerekli kaynakları ve ihtiyaçları için en uygun kaynağı seçmeyi öğreneceklerdir. Bu derste aynı zamanda lisans öğrencilerine, moleküler biyoloji ve genetik laboratuvar işlemlerinde gerekli olan Microsoft Excel'in temel kavramları ve görüntü analiz programı olan ImageJ uygulamaları tanıtılacaktır.
Ders İçeriği
HAFTA KONULAR
1. Hafta Biyolojik bilimler ve bilişim teknolojileri ilişkisi
2. Hafta Literatür taramasında internet kullanımı, kütüphane elektronik kaynakların kullanımı
3. Hafta Excel'e giriş ve ekran öğeleri, formüller, veri menüsü işlemleri, standart sapma, ortalama hesaplamaları, grafik çizimi, doğrusal regresyon
4. Hafta Spektrofotometrik ölçümler sonucu elde edilen standart eğriden yararlanılarak yapılan konsantrasyon hesaplamalarında Excel kullanımı
5. Hafta Proteinlerin analizleri sonucu elde edilen standart eğriler ve konsantrasyon hesaplamaları
6. Hafta Hücre canlılığı, toksisite ve analizlerinde Excel kullanımı
7. Hafta Hücre sayısı analizinde Excel ve ImageJ kullanımı
8. Hafta Bakteriyel hücre büyümesi eğrilerinin oluşturulmasında Excel kullanımı
9. Hafta Nükleik asitlerin analizi ve Excel kullanımı: PicoGreen analizi sonucu elde edilen standart eğriden yararlanılarak yapılan DNA konsantrasyon hesaplamaları
10. Hafta Elektroforez uygulamalarında Excel ve ImageJ kullanımı: dansitometri, jel elektroforez ile DNA fragment analizi
11. Hafta Biyolojik veritabanları: NCBI (BLAST, protein model veritabanları, protein yapı veritabanları, protein dizisi veritabanları, nükleotid dizisi veritabanları, RNA dizisi veritabanları)
12. Hafta Gerçek zamanlı PCR primer ve prob tasarımı
13. Hafta UCSC In-Silico PCR gen tarama aracının kullanımı
14. Hafta Tartışma
KaynaklarDers notları, elektronik kaynaklar.
Öğretim Yöntemleri
  • Anlatım
  • Tartışma
  • Soru-Cevap
  • Sorun/Problem Çözme
  • Eğitim-Uygulama
  • Sunum
Değerlendirme
Sayısı Toplam Katkısı (%)
Ara Sınav 1 40
Ödev 5 15
Toplam(%) 55
Yıl İçinin Başarıya Oranı(%) 55
Finalin Başarıya Oranı(%) 45
Toplam(%) 100
AKTS İş Yükü
Aktivite Sayı Süre (Saat) İş Yükü
Ara Sınav 1 2 2
Kısa Sınavlara hazırlık
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi
Final Sınavına Hazırlık 1 10 10
Ders Saati 14 2 28
Ara Sınava Hazırlık 1 10 10
Laboratuvar
Final Sınavı 1 2 2
Ödevler 5 2 10
Toplam İş Yükü62
Toplam İş Yükü / 302.06
Dersin AKTS Kredisi2
Dilİngilizce
Staj / UygulamaYok
Ö1 Ö2 Ö3 Ö4 Ö5
P1 X X X
P2 X X
P3 X X
P4 X
P5 X
P6 X X X X X
P7 X X X X
P8 X X X X X
P9 X X
P10 X X X X
P11 X X
P12 X X
P13 X X