FONKSİYONEL GENOMİK

MBG419

Ders Kodu: MBG419
Yarıyıl: -
Teori+Uygulama: 3 + 0
AKTS: 4

Dersin Türü

Seçmeli

Dersin Düzeyi

Lisans

Dersin Yılı

Dersin Yarıyılı

AKTS

Öğretim Eleman(lar)ı

Öğretim Görevlisi Selin Akad Dinçer

Öğrenme Kazanımları

Bu dersin sonunda öğrenciler;

Fonksiyonel genomik çalışmalarının kapsamını, gen haritalama ve DNA dizi analizi teknolojilerinin temel prensiplerini anlar.
Fonksiyonel genomiğin genetik hastalıkların tanısında uygulamalarını bilir.
Gen belirleme, genom anotasyonu ve karşılaştırmalı genomik stratejilerini anlar.
Bütünleşmiş genomik, sistem biyolojisi ve meta-genomik yaklaşımları hakkında bilgi sahibi olur.
Ders içeriği kapsamında ilgi alanı doğrultusunda literatür araştırması yapabilir ve sonuçlarını tartışabilir.

Veriliş Biçimi

Yüz Yüze

Önkoşullar

Yok

Önerilen Dersler

Yok

Ders Tanımı

Bu dersin amacı biyoinformatik ve fonksiyonel genomikte kullanılan yöntemleri tanıtmaktır. Bu derste ökaryot organizmaların çeşitli koşullar karşısında tüm genom seviyesinde verdiği cevap analizlerinin nasıl yapıldığı tartışılacaktır.

Ders İçeriği

HAFTA	KONULAR
1. Hafta	Fonksiyonel genomik tanım ve kapsam
2. Hafta	Genom organizasyonu ve yapısı
3. Hafta	Genomu düzenleyen moleküler mekanizmalar
4. Hafta	DNA tamir mekanizmaları
5. Hafta	Genom haritalama
6. Hafta	Genetik hastalıklar ve fonksiyonel genomik uygulamalar
7. Hafta	Genom Düzenleme Teknolojiler
8. Hafta	Genom Düzenleme Teknolojiler
9. Hafta	Gen belirleme
10. Hafta	Biyoinformatik ve genom anotasyonu stratejileri
11. Hafta	Karşılatırmalı genomik
12. Hafta	Bütünleşmiş genomik ve sistem biyolojisi
13. Hafta	Meta-genomik
14. Hafta	Öğrenci projeleri ve tartışma

Kaynaklar

Principles of Gene Manipulation and Genomics, 7th Edition. S.B. Primrose and R.M. Twyman. Blackwell Publishing, 2006
Thompson & Thompson Genetics in Medicine. Robert L. Nussbaum, Roderick R. McInnes, Huntington F Willard. 9th, 2023
Temel ve İleri Moleküler Biyoloji Yöntemleri Genomik ve Proteomik Analizler. Temizkan G, Arda N. Nobel Tıp Kitapevleri
Bilimsel makaleler

Öğretim Yöntemleri

Anlatım
Tartışma
Proje
Sunum

Değerlendirme

	Sayısı	Toplam Katkısı (%)
Ara Sınav	1	35
Proje	1	15
Devam	1	5
Toplam(%)		55
Yıl İçinin Başarıya Oranı(%)		55
Finalin Başarıya Oranı(%)		45
Toplam(%)		100

AKTS İş Yükü

Aktivite	Sayı	Süre (Saat)	İş Yükü
Ara Sınav	1	2	2
Kısa Sınavlara hazırlık
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi
Final Sınavına Hazırlık	1	30	30
Ders Saati	14	3	42
Ara Sınava Hazırlık	1	25	25
Laboratuvar
Final Sınavı	1	2	2
Ödevler	1	20	20
Proje
Toplam İş Yükü			121
Toplam İş Yükü / 30			4.03
Dersin AKTS Kredisi			4

Dil

Türkçe

Staj / Uygulama

Yok

Program Yeterlilikleri / Öğrenme Kazanımları

	Ö1	Ö2	Ö3	Ö4	Ö5
P1
P2	X	X	X	X	X
P3
P4
P5			X	X	X
P6					X
P7					X
P8	X	X	X	X	X
P9	X	X	X	X	X
P10	X	X	X	X	X
P11					X
P12					X
P13

	Ö1	Ö2	Ö3	Ö4	Ö5
P1
P2	X	X	X	X	X
P3
P4
P5			X	X	X
P6					X
P7					X
P8	X	X	X	X	X
P9	X	X	X	X	X
P10	X	X	X	X	X
P11					X
P12					X
P13

	Ö1	Ö2	Ö3	Ö4	Ö5
P1
P2	X	X	X	X	X
P3
P4
P5			X	X	X
P6					X
P7					X
P8	X	X	X	X	X
P9	X	X	X	X	X
P10	X	X	X	X	X
P11					X
P12					X
P13

	Ö1	Ö2	Ö3	Ö4	Ö5
P1
P2	X	X	X	X	X
P3
P4
P5			X	X	X
P6					X
P7					X
P8	X	X	X	X	X
P9	X	X	X	X	X
P10	X	X	X	X	X
P11					X
P12					X
P13