Bilgi Paketi

Bilgisayar Mühendisliği Programı (%30 İngilizce)

BİL466

BİYOBİLİŞİM

Ders Kodu
BİL466
Yarıyıl
-
Teori+Uygulama
3 + 0
AKTS
5
Dersin TürüSeçmeli
Dersin DüzeyiLisans
Dersin Yılı-
Dersin Yarıyılı-
AKTS5
Öğretim Eleman(lar)ı -
Öğrenme Kazanımları

Bu dersin sonunda öğrenciler;

  1. Global ve Lokal Sekans Hizalamayı öğrenir.
  2. Sekansların İstatistiksel Anlamlılığı hakkında bilgi sahibi olur.
  3. Sonek Ağacı ve Sonek Dizilerini öğrenir.
  4. Pozisyona Özgü Skorlama Matrisi, Gizli Markov Modelleri ve Çoklu Sekans Hizalama yöntemlerini uygular.
  5. Filogenetik Ağaçlar hakkında bilgi sahibi olur.
  6. Protein Yapılarını öğrenir.
  7. Mikrodiziler hakkında bilgi sahibi olur.
  8. Biyolojik Ağları bilir.
Veriliş BiçimiYüz Yüze
ÖnkoşullarYok
Önerilen DerslerYok
Ders TanımıMerkezi Dogma. Global ve Lokal Sekans Hizalama. Sonek Ağacı ve Sonek Dizileri. Pozisyona Özgü Skorlama Matrisi. Filogenetik Ağaçlar. Protein Yapıları. Biyobilişimde Makine Öğrenmesi.
Ders İçeriği
HAFTA KONULAR
1. Hafta Biyobilişime Giriş
2. Hafta Biyolojide Merkezi Dogma
3. Hafta Protein Yapısı ve Amino Asitler
4. Hafta Sekans Hizalama
5. Hafta Sekans Hizalama
6. Hafta Filogenetik Ağaçlar
7. Hafta Sonek Ağacı ve Sonek Dizileri
8. Hafta Ara-sınav
9. Hafta Biyobilişimde Makine Öğrenme
10. Hafta Biyobilişimde Makine Öğrenme
11. Hafta Biyobilişimde Makine Öğrenme
12. Hafta Proje Sunumları
13. Hafta Proje Sunumları
14. Hafta Proje Sunumları
15. Hafta Genel Tekrar
Kaynaklar1. Zvelebil Marketa, Baul Jeremy O., Understanding Bioinformatics, 1/E, ISBN: 0815340249, Garland Science, 2007
2. Claverie Jean-Michel, Notredame Cedric, Bioinformatics for Dummies, 2/E, ISBN: 0470089857, Wiley Publishing, 2007
Öğretim Yöntemleri
  • Soru-Cevap
  • Anlatım
  • Proje
  • Eğitim-Uygulama
  • Diğer
Değerlendirme
Sayısı Toplam Katkısı (%)
Ara Sınav 1 30
Mini-Sınav 4 12
Proje 1 15
Devam 1 3
Toplam(%) 60
Yıl İçinin Başarıya Oranı(%) 60
Finalin Başarıya Oranı(%) 40
Toplam(%) 100
AKTS İş Yükü
Aktivite Sayı Süre (Saat) İş Yükü
Ara Sınav 1 1.5 1.5
Kısa Sınavlara hazırlık
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi
Final Sınavına Hazırlık 1 20 20
Ders Saati 14 3 42
Ara Sınava Hazırlık 1 15 15
Laboratuvar
Final Sınavı 1 1.5 1.5
Ödevler
Proje 1 70 70
Kısa Sınavlar 4 0.5 2
Toplam İş Yükü152
Toplam İş Yükü / 305.06
Dersin AKTS Kredisi5
DilTürkçe
Staj / UygulamaYok
Ö1 Ö2 Ö3 Ö4 Ö5 Ö6 Ö7 Ö8
P1
P2
P3 X X X X X X X X
P4
P5
P6
P7
P8
P9
P10
P11 X X X X X X X X