| Dersin Türü | Seçmeli |
|---|
| Dersin Düzeyi | Tezli Yüksek Lisans |
|---|
| Dersin Yılı | - |
|---|
| Dersin Yarıyılı | - |
|---|
| AKTS | 10 |
|---|
| Öğretim Eleman(lar)ı |
|
| Öğrenme Kazanımları |
Bu dersin sonunda öğrenciler;
- Biyoinformatiğin kapsamıı, biyolojik veritabanlarını, dizi hizalama ve veritabanlarında benzerlik taramasının temel prensiplerini ve temel algoritmaları anlar.
- Temel tahminleme ve moleküler filogenetik uygulamalarını bilir.
- Yapısal biyoinformatik çalışmalarını anlar.
- Fonksiyonel genomik uygulamalarını anlar.
- Ders içeriğinin bilgisayardaki tüm uygulamalarını yapabilir, ilgi alanı doğrultusunda çalışma yapabilir ve sonuçlarını tartışabilir.
|
| Veriliş Biçimi | Yüz Yüze |
|---|
| Önkoşullar | Yok |
|---|
| Önerilen Dersler | Yok |
|---|
| Ders Tanımı | Bu ders kapsamında;Biyoinformatiğin kapsamı, biyolojik veritabanları, dizi hizalama ve veritabanlarında benzerlik taramasının temel prensipleri ve temel algoritmalar,Temel tahminleme ve moleküler filogenetik uygulamaları,Yapısal biyoinformatik çalışmaları,Fonksiyonel genomik uygulamaları anlatılır. |
|---|
| Ders İçeriği |
| HAFTA |
KONULAR |
|
1. Hafta |
Biyoinformatik Tanım ve Kapsam |
|
2. Hafta |
Biyolojik Veritabanları |
|
3. Hafta |
Dizi Hizalama |
|
4. Hafta |
Veritabanlarında Benzerlik |
|
5. Hafta |
Temel Algoritmalar |
|
6. Hafta |
Gen Tahminleme |
|
7. Hafta |
Promotör ve Düzenleyici Bölge Tahminlemeleri |
|
8. Hafta |
ARA SINAV |
|
9. Hafta |
Filogenetik Ağaçlar |
|
10. Hafta |
Yapısal Biyoinformatik I: Proteinler |
|
11. Hafta |
Yapısal Biyoinformatik II: İkincil RNA Yapıları |
|
12. Hafta |
Genom Haritalama ve Karşılaştırma |
|
13. Hafta |
Mikroaray Analizleri |
|
14. Hafta |
Öğrenci Projeleri ve Tartışma |
|
15. Hafta |
|
|
| Kaynaklar | Essential Bioinformatics. Jin Xiong. Cambridge University Press, 2006. |
|---|
| Öğretim Yöntemleri |
- Anlatım
- Tartışma
- Soru-Cevap
- Sunum
|
|---|
| Değerlendirme |
|
Sayısı |
Toplam Katkısı (%) |
| Ara Sınav |
1 |
35 |
| Uygulama/Pratik |
1 |
25 |
| Toplam(%) |
|
60 |
| Yıl İçinin Başarıya Oranı(%) |
|
60 |
| Finalin Başarıya Oranı(%) |
|
40 |
| Toplam(%) |
|
100 |
|
| AKTS İş Yükü |
| Aktivite |
Sayı |
Süre (Saat) |
İş Yükü |
| Ara Sınav |
1 |
84 |
84 |
| Kısa Sınavlara hazırlık |
1 |
16 |
16 |
| Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi |
0 |
0 |
0 |
| Final Sınavına Hazırlık |
1 |
24 |
24 |
| Ders Saati |
14 |
3 |
42 |
| Ara Sınava Hazırlık |
1 |
11 |
11 |
| Laboratuvar |
0 |
0 |
0 |
| Final Sınavı |
1 |
96 |
96 |
| Ödevler |
1 |
12 |
12 |
| Proje |
1 |
12 |
12 |
| Toplam İş Yükü | 297 |
| Toplam İş Yükü / 30 | 9.9 |
| Dersin AKTS Kredisi | 10 |
|
| Dil | Türkçe |
|---|
| Staj / Uygulama | Yok |
|---|
